17 yaşındaki suikastçı Codename 13’ün yaşamının iplerini bir kez daha çözmek üzeredir. Ölümcül sanatında mükemmel bir ustalık kazanmış olan 13, Gölge adındaki gizli suikast kolektifinin en değerli elemanıdır. Ancak, Japonya’daki bir görevde yaptığı kritik hata, onu akıl hocası Umbra tarafından Endonezya’nın Cakarta şehrine sürgün edilmekten kurtaramaz. Cakarta’da saklanmaya çalışırken, annesini acımasız bir suç örgütüne kaptırmış olan 11 yaşındaki Monji ile karşılaşır. Monji’nin hayatta kalma mücadelesi, 13’ün içindeki bastırılmış vicdanı uyandırır. Ancak Monji aniden kaybolduğunda, 13, onu kurtarmak için harekete geçer; bu karar, yalnızca suç örgütlerine karşı değil, aynı zamanda onu yetiştiren Gölge’ye ve akıl hocası Umbra’ya meydan okumak demektir. Artık, önüne çıkan her engeli acımasızca yıkmaya kararlıdır. Kendi karanlık geçmişiyle yüzleşirken, Monji’yi kurtarmak için tüm fedakarlıkları göze alacaktır.